Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms