Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms