Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms