Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms