Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms