Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1AP62820 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms