Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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TMEM258P61165 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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