Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms