Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP98P52948 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP98P52948 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP98P52948 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP98P52948 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP98P52948 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP98P52948 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP98P52948 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP98P52948 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP98P52948 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms