Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDF5P43026 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GDF5P43026 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GDF5P43026 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GDF5P43026 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GDF5P43026 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GDF5P43026 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDF5P43026 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDF5P43026 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDF5P43026 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GDF5P43026 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDF5P43026 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GDF5P43026 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms