Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRPPRCP42704 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms