Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms