Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGM1P36871 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms