Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP6P35125 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP6P35125 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP6P35125 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP6P35125 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP6P35125 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP6P35125 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP6P35125 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP6P35125 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP6P35125 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP6P35125 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms