Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTF4P34130 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTF4P34130 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NTF4P34130 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms