Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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HOXA13P31271 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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