Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX2P28328 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms