Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIAP25963 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms