Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HOXA5P20719 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA5P20719 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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