Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME1P15531 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME1P15531 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME1P15531 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME1P15531 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms