Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms