Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT10P13645 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT10P13645 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT10P13645 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT10P13645 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT10P13645 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT10P13645 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT10P13645 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT10P13645 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms