Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GP1BBP13224 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms