Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEPDP12955 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEPDP12955 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEPDP12955 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEPDP12955 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEPDP12955 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEPDP12955 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms