Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms