Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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