Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP2O95045 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms