Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP4O75379 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms