Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms