Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms