Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms