Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELL2O00472 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELL2O00472 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELL2O00472 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELL2O00472 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELL2O00472 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELL2O00472 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELL2O00472 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELL2O00472 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELL2O00472 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELL2O00472 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms