Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DFFAO00273 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms