Protein–RNA interactions for Protein: O00110

OVOL3, Putative transcription factor ovo-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OVOL3O00110 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
OVOL3O00110 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OVOL3O00110 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OVOL3O00110 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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