Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVH48-1M5A8F1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVH48-1M5A8F1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms