Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3QRK9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3QRK9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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