Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms