Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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