Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF2Q9Y5W3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms