Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP3Q9Y3E7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms