Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms