Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms