Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms