Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI30

TRMT112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT112Q9UI30 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT112Q9UI30 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT112Q9UI30 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms