Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNMT3BQ9UBC3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms