Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD5Q9P267 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms