Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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