Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCIQ9NVI1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms