Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms