Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC4BQ9NT99 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4BQ9NT99 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms